Durante la tua avventura a Hoenn incontrerai due gruppi in lotta per la supremazia, il Team Magma e il Team Idro, guidati da un capo che ha al suo fianco due tenenti, un uomo e una donna. Questi tenenti, a loro volta, hanno ai loro ordini numerose Reclute che si occupano delle missioni sul campo.
In Pokémon Rubino Omega il nemico sarà il Team Magma, che desidera espandere la terraferma per incrementare la superficie a disposizione degli esseri umani, in modo che questi possano raggiungere un ulteriore grado di sviluppo ed evoluzione. I suoi seguaci sono convinti che il progresso dell'umanità porterà il mondo intero verso la felicità. Per loro, l'ideale di coesistenza tra esseri umani e Pokémon sullo stesso piano non è realistico e, anzi, ostacola il progresso.
In Pokémon Zaffiro Alpha invece il nemico sarà il Team Idro, che progetta di espandere i mari per restituire ai Pokémon un habitat adatto a loro in un mondo ormai compromesso dalla cupidigia degli esseri umani. Per i seguaci di questo team il mare, fonte della vita, è l'ambiente migliore per garantire la prosperità dei Pokémon.
Il Team Magma è guidato da Max, aiutato dai suoi due Magmatenenti Ottavio e Rossella, che comandano uno stuolo di Reclute. L'obiettivo del Team Magma è far evaporare le acque dei mari per espandere la superficie delle terre emerse.
Il Team Idro è guidato da Ivan, aiutato dagli Idrotenenti Alan e Ada. Il gruppo conta inoltre numerose Reclute. Questa organizzazione ha intenzione di sommergere il mondo con un diluvio senza precedenti per far salire il livello dei mari.







